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中国当代医药  2022, Vol. 29 Issue (7): 11-14转19    
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基于网络药理学的葛根降糖机制研究
舒建中1 李颖慧2 蒲雨晴2 刘庆灵2 张娟2 甘玉立2 谢永芳2▲
1.重庆市中医院脑病科 2.重庆邮电大学生物信息学院
Study on hypoglycemic mechanism of Radix Puerariae based on network pharmacology
SHU Jianzhong1 LI Yinghui2 PU Yuqing2 LIU Qingling2 ZHANG Juan2 Gan Yuli2 XIE Yongfang2▲
1.Department of Encephalopathy,Chongqing Traditional Chinese Medicine Hospital 2.College of Bioinformatics,Chongqing University of Posts and Telecommunications
全文: PDF (1547 KB)   HTML (1 KB) 
输出: BibTeX | EndNote (RIS)      
摘要 目的 基于网络药理学方法研究葛根发挥降糖作用的主要活性成分、作用靶点,分析和寻找葛根发挥药效作用的通路,了解其多靶点多通路协同作用机制。方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库获得葛根相关靶点,通过蛋白质相互作用数据库平台及基因功能分析平台获得相关通路及功能注释信息并分析,通过蛋白质网络分析软件构建蛋白质相互作用网络及“化合物-靶点-信号通路-功能”网络进一步确定其多靶点特性,通过分子复合体检测插件,结合其功能和通路对蛋白质相互作用网络进行聚类,获得不同的模块及每个模块的关键基因。通过分子对接对葛根成分小分子及其作用靶点的结合进行验证。结果 筛选到芒柄花黄素、谷甾醇、3′-甲氧基大豆苷元及大豆苷元-4′,7-二葡萄糖苷四种成分。获得3 个主要靶点为CYP17A1、NR3C1 和HTR2C。结论 通过对靶点功能、通路以及蛋白质相互作用网络的综合分析,共获得3 个靶点模块,通过分析其降糖中可能的作用机制及研究现状,能够为葛根的高效利用提供一定的基础。
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作者相关文章
舒建中
李颖慧
蒲雨晴
刘庆灵
张娟
甘玉立
谢永芳
关键词 葛根生物信息学网络药理学靶点分子对接信号通路    
Abstract:Objective To study the main active components and targets of Radix Puerariae in hypoglycemic action based on network pharmacology,analyze and find the pathway of Radix Puerariae to exert its pharmacodynamic effect and to understand its synergistic mechanism of multi-target and multi-pathway.Methods The related targets of Radix Puerariae were obtained by using the pharmacology database and analysis platform of traditional Chinese medicine system(TCMSP),and the related pathways and functional annotation information were obtained and analyzed by protein-protein interaction database platform and gene function analysis platform.By protein protein interaction networks and network analysis software "compounds-target-signal path-function" network to further determine the target features,through the molecular complex testing plug-ins,combined with its function and pathways for the clustering of proteinprotein interaction networks,different modules and each module of key genes.The binding of small molecular components of pueraria root and their targets was verified by molecular docking.Results Four components including formononetin,sitosterol,3′-methoxydaidzein,daidzein-4′,7-diglucoside were screened.Three main targets CYP17A1,NR3C1 and HTR2C were obtained.Conclusion Through the comprehensive analysis of target function,pathway and protein-protein interaction network,three target modules were obtained.By analyzing their possible mechanism of action in hypoglycemia and their research status,it can provide a certain basis for the efficient utilization of Radix Puerariae.
Key wordsRadix Puerariae    Bioinformatics    Network pharmacology    Targets    Molecular docking    Signal pathway
    
基金资助:重庆市自然科学基金面上项目(cstc2020jcyj-ms xmX0739);重庆邮电大学大学生科研训练计划项目(E011 A2019246)。
通讯作者: 谢永芳(1971-),女,博士,副教授,研究方向:生物信息。   
作者简介: 舒建中(1973-),男,硕士,主任医师,研究方向:中医学。
引用本文:   
舒建中;李颖慧;蒲雨晴;刘庆灵;张娟;甘玉立;谢永芳. 基于网络药理学的葛根降糖机制研究[J]. 中国当代医药, 2022, 29(7): 11-14转19.
SHU Jianzhong;LI Yinghui;PU Yuqing;LIU Qingling;ZHANG Juan;Gan Yuli; XIE Yongfang. Study on hypoglycemic mechanism of Radix Puerariae based on network pharmacology. 中国当代医药, 2022, 29(7): 11-14转19.
链接本文:  
https://www.dangdaiyiyao.com/CN/     或     https://www.dangdaiyiyao.com/CN/Y2022/V29/I7/11
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